基因疗法新拼图:算法揭示 188 种新型 CRISPR 系统
该项目由 CRISPR 技术先驱张锋教授带领,示种团队成员来自麻省理工学院麦戈文脑研究所、基因麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所以及美国国立卫生研究院国家生物技术信息中心(NCBI)等,疗法相关成果于 11 月 23 日发表在《Science》期刊上。新拼新型系统
团队开发出新的图算搜索算法--基于快速局部敏感哈希聚类算法(FLSHclust),使用该算法深入挖掘三个主要的法揭公共数据库,从中识别出了 188 种新型 CRISPR 系统,示种并对其中 4 个系统进行了详细表征。基因
这些新系统可能被用来编辑哺乳动物细胞,疗法其脱靶效应比目前的新拼新型系统 CRISPR-Cas9 系统要少,也有可能在被用于诊断或用来记录细胞内部活动。
该研究发现了几种已知 I 型 CRISPR 系统的新变体,未来能被用于开发更精准的基因编辑技术。
此外,研究人员还发现了一些 IV 型 CRISPR 系统的新的作用机制,以及精确靶向 RNA 的 VII 型系统(有可能被用于 RNA 编辑)。研究人员表示,该研究突出了 CRISPR 系统前所未有的多样性和灵活性。
附上论文参考地址:Han Altae-Tran et al.,Uncovering the functional diversity of rare CRISPR-Cas systems with deep terascale clustering.Science382,eadi1910(2023).DOI:10.1126/science.adi1910
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